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师资力量
张秀任
杰出教授

生物科学系

电子邮件:xiuren.zhang@suat-sz.edu.cn

个人简介

张秀任担任过德州农工大学生物化学与生物理系Christine Richardson讲席教授. 张博士是全球知名的RNA生物学和植物科学领域专家,长期致力于植物RNA沉默、RNA二级结构、表观遗传学、转录组修饰及宿主-病毒互作等方向的研究,以唯一或主要(leading)通讯作者身份在Cell、 Nature、Nat. Plants、Sci. Adv.和Dev. Cell等顶级期刊发表了一系列开创性研究成果,其科研成果至少被国外媒体报道超过20次, 年引用次数700左右。 张博士累计获得超过NIH 和NSF等多个机构1800万美元的科研经费。张博士因其卓越的科研能力,获得了AgriLife Faculty Fellow、Presidential Impact Fellow、Chancellor EDGES Fellow以及早期的NSF CAREER奖等多项荣誉。张博士被评选上美国促进会会士(AAAS Fellow)。

研究领域

1.在植物中鉴定RNA沉默途径的新组分并开展作用机制研究;

2.破解RNA二级结构和RNA表观修饰中蕴含的遗传信息与生物学功能;

3.内禀无序蛋白的功能分析及其转化应用;

4.通过RNA驱动的合成生物学改良关键农业性状、开发生物技术产品并促进人类健康。

学习工作经历

学习经历:

1999-2003: 美国康奈尔大学, 植物生物学, 博士

1997-1999: 美国奥本大学, 园艺学,硕士

1991-1994: (北京)中国农业大学, 园艺学, 硕士

1985-1989: 皖南农学院 (合肥经济技术学院),经济植物学, 本科

工作经历:

2026年1月至今:深圳理工大学合成生物学院杰出教授

2023年9月-2025年7月: 美国德州农工大学生物化学与生物物理系Christine Richardson 讲席教授

2020年2月-2025年7月: 美国德州农工大学生物系双聘教授

2008年8月-2023年8月: 美国德州农工大学生物化学与生物物理系助理教授, 副教授,和教授

2003年9月-2008年7月: 美国洛克菲勒大学植物分子生物学博士后

代表性会议经历

1.2024年ASBP会议,夏威夷,2024年6月23–27日;

2.调控性与非编码RNA,冷泉港,2024年5月14–18日;

3.第31届动植物基因组大会,圣地亚哥,2024年1月12–16日;

4.国际植物病毒互作大会,中国杭州,2023年10月10日;

5.中国生物调查研究者年会,拉斯维加斯,2022年12月19–22;

6.第33届阿根廷植物生理学会议,2021年9月16–22日;

7.植物RNA结构研讨会,约翰·英尼斯中心,2021年9月7–9日;

8.Saclay植物科学大会,巴黎大学,2020年9月15日;

9.韩国生物化学与分子生物学学会(KSBMB)国际会议,韩国济州岛,2019年6月3–6日;

10.第四届全国玉米生物学学术大会(中国),2019年4月19–21日(特邀主题报告人);

11.FASEB科学研究会议:基因表达的转录后调控——RNA衰变机制,美国亚利桑那州,2018年6月24–29日;

12.第十三届小RNA微型研讨会,奥地利维也纳,2018年6月18–20日;

13.植物表观遗传学、信号转导与发育研讨会,深圳大学,2017年7月29日;

14.第19届国际植物学大会,中国深圳,2017年7月24日;

15.第7届国际双生病毒研讨会,中国杭州,2014年11月20日;

16.植物中的转录后基因调控,美国罗德岛,2013年7月26日。

代表性科研项目

1.Functions and mechanisms of new components in RNA silencing;2024.2.1 – 2029.1.31;美国国立卫生研究院;唯一PI,因PI离开美国,项目于2025年停止;

2.Function and mechanism of Coat protein complex I in RNA silencing;2023.12.1 – 2027.12.1;美国国家科学基金会分子与细胞生物学项目(NSF MCB);唯一PI,因PI离开美国,项目于2025年停止;

3.Roles of SWI/SNF complexes in posttranscriptional processing of RNA;2019.4.1 – 2024.5.31;美国国立卫生研究院;唯一PI;

4.Suppression mechanism of Geminivirus-encoded TrAP protein;2018.12.21 – 2023.11.30;美国国立卫生研究院;唯一PI;

5.Roles of the SERRATE protein in regulation of miRNA biogenesis and transposable element silencing in Arabidopsis thaliana;2017.11.15 – 2022.11.14;美国国家科学基金会;唯一PI;

6.CAREER: Arabidopsis Argonaute10-protein interactome;2013.6.15 – 2019.5.14;美国国家科学基金会;唯一PI;

7.Pathogenesis Mechanism of Geminivirus-Encoded AL2;2012.2.1 – 2015.1.31;美国国家科学基金会;唯一PI;

8.Argonaute-RNA interactome in Arabidopsis;2010.2.1 – 2014.1.31;美国国家科学基金会;唯一PI;

9.Biochemical basis of liquid-liquid phase separation and impact of DSPPL in microRNA production factory;2011.6.1 – 2026.5.31;韦尔奇基金会;唯一PI;

10.Exploring LLPS-featured SAID homologs to improve agricultural traits;2023.7.6 – 2028.7.6;HATCH(美国农业部HATCH研究基金);PI(唯一)。

代表性文章

1. Zhong S, Oh TR, Li X, Zhang J, Choi SW, Gao C, Peng X, Dong J, He C, Zhang X. CDS-localized m6A drives co-translational RNA decay to relieve biotic and abiotic endoplasmic reticulum stresses. Nat Plants. 2026 May;12(5):1062-1078. doi: 10.1038/s41477-026-02299-4.

2. Zhu J, Li C, Onyia C, Li X, Yan X, Zhong S, Oh T, Zhang X. DMS-MaPseq and DREEM Analyses Implicate the Critical Role of RNA Structural Dynamics in Turnip Yellow Mosaic Virus Pathogenicity. Adv Sci. 2026 May 8:e75614. doi: 10.1002/advs.2025075614.

3. Zhong S, Li X, Bai C, Chen J, Gan L, Zhu J, Oh T, Yan X, Zhu J, Li N, Koiwa H, Meek T, Peng X, Yu B, Zhang Z**, Zhang X. SERRATE drives phase separation behaviours to regulate m6A modification and miRNA biogenesis. Nat Cell Biol. 2024. doi: 10.1038/s41556-024-01528-w.

4. Li X, Zhong S, Li C, Yan X, Zhu J, Li Y, Wang Z, Peng X, Zhang X. RNA helicase Brr2a promotes miRNA biogenesis by properly remodeling secondary structure of pri-miRNAs. Nat Plants. 2024. doi: 10.1038/s41477-024-01788-8.

5. Yan X, Li C, Liu K, Zhang T, Xu Q, Li X, Zhu J, Wang Z, Yusuf A, Cao S, Peng X, Cai JJ, Zhang X. Parallel degradome-seq and DMS-MaPseq substantially revise the miRNA biogenesis atlas in Arabidopsis. Nat Plants. 2024. doi: 10.1038/s41477-024-01725-9.

6. Zhang T, Li C, Zhu J*, Li Y, Wang Z, Tong C, Xi Y, Han Y, Koiwa H, Peng X, Zhang X. Structured 3' UTRs destabilize mRNAs in plants. Genome Biol. 2024 Feb 22;25(1):54. doi: 10.1186/s13059-024-03186-x.

7. Wang Z, Zhao C, Tong C, Castillo-González C, Li C, Xie K, Zhu J, Jacob Y, Michaels S, Jacobsen S, Peng X, Zhang X. Mutations of histone methyltransferases confer Geminivirus resistance via retaining DNA repair proteins onto rDNA and defense genes in Arabidopsis. Nat Commun. 2023 Nov 18;14(1):7484. doi: 10.1038/s41467-023-43311-1.

8. Shang B, Wang L, Yan X*, Li C, Wu C, Wang T, Choi SW, Wang Z, Peng X, Zhang X. Intrinsically disordered proteins SAID1/2 condensate on SERRATE/ARS2 for dual inhibitions of miRNA biogenesis in Arabidopsis. PNAS. 2023 Apr 4;120(14):e2216006120. doi: 10.1073/pnas.2216006120.

9. Wang L, Yan X, Li Y, Wang Z, Chhajed S, Shang B, Wang Z, Choi SW, Zhao H, Chen S, Zhang X. PRP4KA phosphorylates SERRATE for degradation via 20S proteasome to fine-tune miRNA production in Arabidopsis. Sci Adv. 2022;8(12):eabm8435. doi: 10.1126/sciadv.abm8435.

10. Sun D, Li Y, Ma Z, Yan X, Li N, Shang B, Hu X, Cui K, Koiwa H, Zhang X. The epigenetic factor FVE orchestrates cytoplasmic SGS3-DRB4-DCL4 activities to promote transgene silencing in Arabidopsis. Sci Adv. 2021;7(32):eabf3898. doi: 10.1126/sciadv.abf3898.

11. Li Y, Sun D, Ma Z, Yamaguchi K$, Wang L, Zhong S, Yan X, Shang B, Nagashima Y, Koiwa H, Han J, Xie Q, Zhou M, Wang Z**, Zhang X. Degradation of Serrate via ubiquitin-independent 20S proteasome to survey RNA metabolism. Nat Plants. 2020 Aug;6(8):970-982. doi: 10.1038/s41477-020-0721-4.

12. Ma Z, Castillo-González C#, Wang Z, Sun D#, Hu X, Shen X, Potok ME, Zhang X. Arabidopsis Serrate Coordinates Histone Methyltransferases ATXR5/6 and RNA Processing Factor RDR6 to Regulate Transposon Expression. Dev Cell. 2018;45(6):769-784.e6. doi: 10.1016/j.devcel.2018.05.023.

13. Wang Z, Ma Z, Castillo-González C, Sun D, Li Y, Yu B, Zhao B, Li P, Zhang X. SWI/SNF subunit CHR2 remodels pri-miRNAs via SE to inhibit miRNA production. Nature. 2018;557(7706):516-521. doi: 10.1038/s41586-018-0117-9.

14. Zhang Z, Guo X, Ge C*, Ma Z, Jiang M, Li T, Koiwa H, Yang SK, Zhang X. KETCH1 (Karyopherin Enabling the Transport of the Cytoplasmic HYL1) imports HYL1 to nucleus for miRNA biogenesis in Arabidopsis. PNAS. 2017;114(15):4011-4016. doi: 10.1073/pnas.1616930114.

15. Zhang Z, Liu X, Guo X, Wang X-J**, Zhang X. Arabidopsis AGO3 predominantly recruits 24-nt small RNAs to regulate epigenetic silencing. Nat Plants. 2016;2:16049. doi: 10.1038/nplants.2016.49.

16. Castillo-González C, Liu X, Huang C, Zhao C, Hu T, Sun F$, Ma Z, Zhou Y, Zhou X, Wang X, Zhang X. Geminivirus-encoded TrAP suppressor inhibits the histone methyltransferase SUVH4/KYP to counter host defense. eLife. 2015 Sep 7;4:e06671. doi: 10.7554/eLife.06671.

17. Zhu H, Zhou Y, Castillo C, Lu A, Zhao Y, Duan L, Li Z, Wang XJ, Zhang X. Bidirectional processing of pri-miRNAs with branched terminal loops by Arabidopsis Dicer-like1. Nat Struct Mol Biol. 2013;20:1106-1115. doi: 10.1038/nsmb.2636.

18. Zhu H, Hu F, Wang R*, Zhou X, Sze SH, Liou L, Barefoot A, Dickman M, Zhang X. The Arabidopsis Argonaute 10 specifically recruits miR166/165 to maintain shoot apical meristem. Cell. 2011;145(2):242-256. doi: 10.1016/j.cell.2011.03.024.

职称 杰出教授 海外职称
系别 生物科学系 职务 Christine Richardson 讲席教授
邮箱 xiuren.zhang@suat-sz.edu.cn 首字母 Z
网址 所在学院 合成生物学院
岗位 教授